Hmmm, könnte es sein daß dein Klimakompressor kaputt ist? Ein Tauschmotor hat nämlich keinen Einfluss auf die Klima, sofern du nicht noch Kabelbaum etc. mitgewechselt hast. Ich würde da eher auf altersbedingten Ausfall tippen.
Meine Vermutung würde vielleicht deshalb passen:
Ursache Problem 1: Die Magnetkupplung der Riemenscheibe funktioniert nicht richtig, deshalb schliesst sie ab und zu nicht sofort, du hast keine Kühlung. Da die Kupplung noch nichtkomplett den Geist aufgegeben hat funktioniert es mal, mal auch nicht.
Ursache Problem 2: Die Kupplung hat Schlupf, d.h. sie schliesst nicht mehr richtig und geht ab und an leicht durch. Deshalb erscheint der Motorlauf unruhig.
Ursache Problem 3: Die Kupplung hat Schlupf, d.h. die Riemenscheibe rutscht und pfeift.
Würde also ganz gutpassen, ist aber nur eine Vermutung.
Schon mal dran gedacht die Klima bei einem Fachbetrieb checken zu lassen?