Schon mal gegoogelt ?? :-))
Wenn Du zwei Avis zusammenfügen willst, dann müssen die auch wirklich 100%ig zu einander passen (vom Codec, FPS und Bildformat aus betrachtet).
Ansonsten wird es halt ein paar Probleme geben.
Avi ist an sich kein Format wie z.B. MPEG. Avi ist nur ein Container, in dem sich alles mögliche verstecken kann. (Film codiert in Cinepak, Sound in MP3 oder ein Teil in DIVx und ach weiß der Geier :-))
Manchmal hilft halt nur decodieren und dann zusammefügen und encodieren.